He borrado una remesa porque no tengo todas las cuentas del banco de los clientes; he dejado todos sus cobros (al cobro) y la he borrado, pero ahora cuando vuelvo a realizar la remesa para seleccionar solo los clientes que sí que tengo cuenta del banco, me aparece en la pantalla de selección de cobros, algunos marcados con una X en la columna d, que coinciden con los que tengo que seleccionar para la remesa, ¿qué significa la columna d?, ¿he borrado mal la remesa?

No has borrado mal la remesa, la columna d significa que el cliente tiene una cuenta bancaria marcada por defecto.

Cuando hiciste la remesa la primera vez ya estarían los cobros marcados en esa columna.

No están marcados todos, como comentas no todos los que seleccionaste tenían cuenta bancaria, por tanto esos no estarán marcados en esa columna y por el contrario los que vas a seleccionar ahora sí que tienen la cuenta por defecto y están marcados, es decir, coincide que todos los que tienes que seleccionar están marcados con una X en la columna d.